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1. Leveraging Different Distance Functions to Predict Antiviral Peptides with Geometric Deep Learning from ESMFold-Predicted Tertiary Structures

   Greneter Cordoves‐Delgado, César R. García‐Jacas, Yovani Marrero‐Ponce, Sergio Andrés Aguila, Gabriel Lizama-Uc

   Antibiotics 2026 Artículo Acceso abierto

   Computational Theory and Mathematics Modelación de Nanomateriales

2. Optimal Descriptor Subset Search via Chemical Information and Target Activity-Guided Algorithm for Antimicrobial Peptide Prediction

   Luis A. García‐González, Yovani Marrero‐Ponce, César R. García‐Jacas, Sergio Andrés Aguila

   Journal of Chemical Information and Modeling 2025 Artículo 1 cita Acceso abierto

   Computational Theory and Mathematics Modelación de Nanomateriales

3. Molecular dynamics and free energy calculations of clozapine bound to D2 and H1 receptors reveal a cardiometabolic mitigated derivative

   Alma C. Castañeda-Leautaud, Abraham Marcelino Vidal Limón, Sergio Andrés Aguila

   Journal of Biomolecular Structure and Dynamics 2022 Artículo

   Computational Theory and Mathematics Modelación de Nanomateriales

4. Improving Structure-Based Virtual Screening with Ensemble Docking and Machine Learning

   Joel Ricci-López, Sergio Andrés Aguila, Michael K. Gilson, Carlos A. Brizuela

   Journal of Chemical Information and Modeling 2021 Artículo 80 citas Acceso abierto

   Computational Theory and Mathematics Modelación de Nanomateriales

5. Structure-Based Virtual Screening of Sterols and Triterpenoids Isolated from Ganoderma (Agaricomycetes) Medicinal Mushrooms Shows Differences in Their Affinity for Human Glucocorticoid and Mineralocorticoid Receptors

   María de la Soledad Lagunes-Castro, Sergio Andrés Aguila, Deissy Herrera‐Covarrubias, María Elena Hernández‐Aguilar, Ángel Trigos, Abraham Marcelino Vidal Limón, Jorge Manuel Suárez-Medellín

   International journal of medicinal mushrooms 2021 Artículo 1 cita

   Computational Theory and Mathematics Modelación de Nanomateriales

6. Druggability prediction of protein conformations using convolutional neural networks

   Joel Ricci-López, Sergio Andrés Aguila, Carlos A. Brizuela

   2021 Otro

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7. Druggability prediction of protein conformations using convolutional neural networks

   Joel Ricci-López, Sergio Andrés Aguila, Carlos A. Brizuela

   2021 Otro

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8. Molecular modeling simulation studies reveal new potential inhibitors against HPV E6 protein

   Joel Ricci-López, Abraham Marcelino Vidal Limón, Matías Zúñiga-Bustos, Verónica A. Jiménez, Joel B. Alderete, Carlos A. Brizuela, Sergio Andrés Aguila

   PLoS ONE 2019 Artículo 47 citas Acceso abierto

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9. Molecular modelling of HPV E6 protein reveal new potential inhibitors against high-risk Human Papillomavirus: Supporting Information

   Joel Ricci-López, Abraham Marcelino Vidal Limón, Matías Zúñiga-Bustos, Verónica A. Jiménez, Joel B. Alderete, Carlos A. Brizuela, Sergio Andrés Aguila

   Figshare 2019 Conjunto de datos Acceso abierto

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